A JASCO cég saját fejlesztésű ChromNAV2 kromatográfiás vezérlő és adatfeldolgozó szoftverével a JASCO LC-4000, LC-2000 és X-LC sorozatba tartozó modulok vezérelhetőek. A szoftver rendszerenként 4 csatornás adatgyűjtésre képes nemcsak JASCO gyártmányú detektorok (UV, FP, CD, RI, ORD) által szolgáltatott jelek feldolgozásával, hanem bármely analóg jelkimenetű kromatográfiás detektor jelének gyűjtésével. A ChromNAV2 tartalmazza a JASCO SpectraManager spektroszkópiás szoftvert is a JASCO UV, FP és CD detektorok által felvett spektrumok kiértékeléséhez. A JASCO MD-4010/4015/4017 diódasoros detektorok által szolgáltatott jelek 3 dimenziós adatfeldolgozásával spektrumok alapján történő csúcsazonosítás vagy csúcstisztaság ellenőrzés is megvalósítható. A detektálás folyamán felvett spektrumokból spektrumkönyvtár hozható létre. A ChromNAV2 szoftvercsomag az adatok kiértékeléséhez tartalmazza a kromatográfiás kiértékelésekhez szükséges programmodulokat a csúcsazonosításhoz, integráláshoz, mennyiségi elemzésekhez, kalibrációs görbék használatához éppúgy, mint az eredmények szakszerű és áttekinthető dokumentálásához. A nyomtatási formátumok szerkeszthetőek, az adatok más programokkal való feldolgozhatóságát pedig az export funkciók könnyítik meg. Újdonságnak számít az e-mail report küldési lehetőség a rendszerállapotról. A szoftvercsomag kiegészíthető a 21 CFR Part 11 követelményeknek megfelelő jelszavas védelemmel, felhasználó szintek létrehozásával elektronikus aláírással, eseménynaplóval (audit trail).